Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms