Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NME3Q13232 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NME3Q13232 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NME3Q13232 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NME3Q13232 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NME3Q13232 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NME3Q13232 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME3Q13232 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME3Q13232 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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