Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms