Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 DDB1-203ENST00000451943 1224 ntTSL 28□□□□□ -1.131e-6■■■□□ 18.6
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TARDBPQ13148 MAEA-215ENST00000512289 2426 ntTSL 216.56■□□□□ 0.244e-6■■■□□ 18.6
TARDBPQ13148 MAEA-204ENST00000503162 2069 ntTSL 215.53■□□□□ 0.084e-6■■■□□ 18.6
TARDBPQ13148 MAEA-220ENST00000515766 3136 ntTSL 214.99□□□□□ -0.014e-6■■■□□ 18.6
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TARDBPQ13148 MEMO1-203ENST00000404530 1482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.992e-6■■■□□ 18.5
TARDBPQ13148 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.562e-6■■■□□ 18.5
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TARDBPQ13148 MEMO1-206ENST00000422936 327 ntTSL 53.98□□□□□ -1.772e-6■■■□□ 18.5
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TARDBPQ13148 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.456e-8■■■□□ 18.5
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TARDBPQ13148 FN3KRP-206ENST00000574356 887 ntTSL 518.84■□□□□ 0.616e-7■■■□□ 18.4
TARDBPQ13148 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.576e-7■■■□□ 18.4
TARDBPQ13148 FN3KRP-204ENST00000573158 627 ntTSL 316.5■□□□□ 0.236e-7■■■□□ 18.4
TARDBPQ13148 FN3KRP-205ENST00000574206 683 ntTSL 316.35■□□□□ 0.216e-7■■■□□ 18.4
TARDBPQ13148 FN3KRP-209ENST00000577128 515 ntTSL 513.24□□□□□ -0.296e-7■■■□□ 18.4
TARDBPQ13148 HK1-202ENST00000359426 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.729e-8■■■□□ 18.3
TARDBPQ13148 HK1-201ENST00000298649 3596 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.769e-8■■■□□ 18.3
TARDBPQ13148 HK1-206ENST00000448642 3868 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.939e-8■■■□□ 18.3
TARDBPQ13148 HK1-203ENST00000360289 3961 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.059e-8■■■□□ 18.3
TARDBPQ13148 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.053e-6■■■□□ 18.3
TARDBPQ13148 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.242e-6■■■□□ 18.3
TARDBPQ13148 AMFR-202ENST00000492830 2249 ntTSL 212.61□□□□□ -0.392e-6■■■□□ 18.3
TARDBPQ13148 AMFR-209ENST00000567738 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.07□□□□□ -0.82e-6■■■□□ 18.3
TARDBPQ13148 PHKB-207ENST00000566037 1032 ntTSL 223.46■■□□□ 1.352e-6■■■□□ 18.3
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TARDBPQ13148 PHKB-206ENST00000565424 828 ntTSL 36.08□□□□□ -1.442e-6■■■□□ 18.3
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TARDBPQ13148 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.023e-9■■■□□ 18.3
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