Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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