Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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TRAF3Q13114 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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TRAF3Q13114 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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TRAF3Q13114 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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TRAF3Q13114 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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TRAF3Q13114 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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