Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RASGEF1BQ0VAM2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms