Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms