Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms