Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms