Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RELAQ04206 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELAQ04206 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELAQ04206 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms