Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4A11Q02928 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms