Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms