Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms