Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK3Q00526 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms