Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms