Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms