Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA52P62987 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA52P62987 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA52P62987 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA52P62987 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA52P62987 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA52P62987 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA52P62987 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA52P62987 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA52P62987 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA52P62987 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA52P62987 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA52P62987 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA52P62987 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA52P62987 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms