Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RPS29P62273 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RPS29P62273 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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