Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms