Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTBP60709 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTBP60709 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTBP60709 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTBP60709 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTBP60709 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTBP60709 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTBP60709 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTBP60709 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTBP60709 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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