Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMDP57764 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms