Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms