Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB28P51157 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB28P51157 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB28P51157 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms