Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME1P48163 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ME1P48163 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME1P48163 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ME1P48163 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME1P48163 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ME1P48163 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME1P48163 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ME1P48163 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ME1P48163 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ME1P48163 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ME1P48163 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ME1P48163 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ME1P48163 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME1P48163 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ME1P48163 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME1P48163 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME1P48163 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ME1P48163 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME1P48163 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ME1P48163 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ME1P48163 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ME1P48163 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME1P48163 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME1P48163 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ME1P48163 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME1P48163 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME1P48163 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME1P48163 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME1P48163 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME1P48163 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME1P48163 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME1P48163 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME1P48163 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME1P48163 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME1P48163 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME1P48163 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms