Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIA4P48058 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms