Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP5P45974 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP5P45974 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP5P45974 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP5P45974 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP5P45974 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP5P45974 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP5P45974 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP5P45974 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP5P45974 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP5P45974 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP5P45974 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP5P45974 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP5P45974 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP5P45974 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP5P45974 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP5P45974 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP5P45974 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP5P45974 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP5P45974 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP5P45974 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP5P45974 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP5P45974 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP5P45974 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP5P45974 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP5P45974 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP5P45974 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP5P45974 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP5P45974 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP5P45974 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP5P45974 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP5P45974 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP5P45974 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP5P45974 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP5P45974 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP5P45974 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP5P45974 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP5P45974 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP5P45974 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP5P45974 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP5P45974 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP5P45974 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP5P45974 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP5P45974 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP5P45974 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP5P45974 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP5P45974 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP5P45974 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP5P45974 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP5P45974 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP5P45974 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP5P45974 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP5P45974 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP5P45974 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP5P45974 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP5P45974 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP5P45974 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms