Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATA4P43694 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA4P43694 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA4P43694 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATA4P43694 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATA4P43694 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms