Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP2P42575 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP2P42575 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP2P42575 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms