Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5C1P36542 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms