Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms