Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
THBS4P35443 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THBS4P35443 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
THBS4P35443 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
THBS4P35443 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
THBS4P35443 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
THBS4P35443 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
THBS4P35443 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
THBS4P35443 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
THBS4P35443 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
THBS4P35443 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
THBS4P35443 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms