Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM5P33992 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM5P33992 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM5P33992 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM5P33992 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM5P33992 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM5P33992 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM5P33992 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM5P33992 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM5P33992 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM5P33992 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM5P33992 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM5P33992 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM5P33992 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM5P33992 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM5P33992 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM5P33992 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM5P33992 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM5P33992 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM5P33992 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM5P33992 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM5P33992 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM5P33992 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM5P33992 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM5P33992 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM5P33992 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM5P33992 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM5P33992 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM5P33992 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM5P33992 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM5P33992 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM5P33992 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM5P33992 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM5P33992 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms