Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms