Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms