Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms