Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMLP26374 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMLP26374 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMLP26374 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMLP26374 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMLP26374 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMLP26374 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMLP26374 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMLP26374 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMLP26374 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMLP26374 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMLP26374 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMLP26374 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMLP26374 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMLP26374 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMLP26374 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMLP26374 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMLP26374 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMLP26374 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMLP26374 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMLP26374 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMLP26374 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMLP26374 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMLP26374 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMLP26374 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMLP26374 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMLP26374 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMLP26374 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMLP26374 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMLP26374 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMLP26374 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMLP26374 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMLP26374 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMLP26374 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMLP26374 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMLP26374 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMLP26374 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMLP26374 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMLP26374 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMLP26374 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMLP26374 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMLP26374 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMLP26374 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMLP26374 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMLP26374 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMLP26374 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMLP26374 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMLP26374 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMLP26374 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMLP26374 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms