Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA3P26006 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms