Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNCP24821 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNCP24821 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNCP24821 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNCP24821 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNCP24821 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNCP24821 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNCP24821 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNCP24821 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNCP24821 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNCP24821 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNCP24821 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNCP24821 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNCP24821 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms