Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1P21675 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1P21675 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1P21675 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1P21675 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1P21675 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1P21675 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1P21675 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1P21675 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1P21675 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1P21675 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1P21675 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1P21675 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1P21675 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1P21675 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1P21675 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1P21675 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1P21675 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1P21675 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1P21675 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1P21675 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1P21675 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1P21675 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1P21675 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1P21675 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1P21675 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1P21675 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1P21675 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1P21675 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1P21675 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1P21675 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1P21675 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1P21675 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1P21675 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1P21675 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1P21675 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1P21675 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1P21675 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1P21675 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1P21675 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1P21675 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1P21675 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1P21675 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1P21675 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1P21675 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1P21675 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1P21675 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1P21675 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1P21675 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1P21675 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1P21675 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1P21675 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TAF1P21675 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TAF1P21675 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TAF1P21675 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TAF1P21675 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TAF1P21675 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TAF1P21675 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1P21675 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1P21675 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1P21675 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1P21675 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1P21675 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1P21675 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1P21675 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1P21675 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1P21675 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1P21675 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1P21675 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1P21675 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1P21675 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1P21675 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1P21675 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1P21675 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1P21675 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1P21675 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1P21675 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1P21675 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms