Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB1P20618 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB1P20618 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB1P20618 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB1P20618 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms