Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DPA1P20036 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms