Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A1P19634 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A1P19634 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A1P19634 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A1P19634 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A1P19634 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A1P19634 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A1P19634 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A1P19634 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A1P19634 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A1P19634 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A1P19634 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A1P19634 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A1P19634 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms