Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XBP1P17861 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
XBP1P17861 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
XBP1P17861 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
XBP1P17861 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XBP1P17861 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XBP1P17861 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms