Protein–RNA interactions for Protein: P17066

HSPA6, Heat shock 70 kDa protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA6P17066 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPA6P17066 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPA6P17066 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPA6P17066 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPA6P17066 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPA6P17066 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPA6P17066 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPA6P17066 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPA6P17066 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPA6P17066 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPA6P17066 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPA6P17066 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPA6P17066 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPA6P17066 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms