Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms