Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms