Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP2C9P11712 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP2C9P11712 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms