Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2P10911 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2P10911 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2P10911 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2P10911 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2P10911 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2P10911 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2P10911 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2P10911 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2P10911 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2P10911 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2P10911 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2P10911 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2P10911 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2P10911 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2P10911 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2P10911 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2P10911 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2P10911 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCF2P10911 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCF2P10911 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCF2P10911 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCF2P10911 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCF2P10911 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCF2P10911 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCF2P10911 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCF2P10911 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCF2P10911 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCF2P10911 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCF2P10911 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCF2P10911 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCF2P10911 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCF2P10911 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCF2P10911 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCF2P10911 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCF2P10911 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCF2P10911 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCF2P10911 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCF2P10911 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCF2P10911 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCF2P10911 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCF2P10911 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCF2P10911 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCF2P10911 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCF2P10911 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCF2P10911 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCF2P10911 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCF2P10911 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCF2P10911 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCF2P10911 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCF2P10911 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCF2P10911 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCF2P10911 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCF2P10911 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCF2P10911 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCF2P10911 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCF2P10911 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCF2P10911 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MCF2P10911 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCF2P10911 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCF2P10911 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCF2P10911 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCF2P10911 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCF2P10911 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCF2P10911 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MCF2P10911 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCF2P10911 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCF2P10911 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCF2P10911 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCF2P10911 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCF2P10911 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCF2P10911 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms