Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms